# An Automated Platform for the CE-MS Analysis of Glycosaminoglycans

> **NIH NIH U01** · UNIVERSITY OF GEORGIA · 2020 · $294,738

## Abstract

Project Summary/Abstract 
 
This project will develop an automated capillary electrophoresis-­tandem mass spectrometry platform for the 
structural analysis of mixtures of glycosaminoglycan oligomers that are isolated in protein binding assays. This 
class of carbohydrates can be found on the surface of all animal cells, and play a key role in many important 
biological processes. Glycosaminoglycans are linear, polysulfated copolymers, typically with a repeating 
disaccharide unit composed of an N-­acetyl-­hexosamine and glucuronic acid, and can be more than 200 repeat 
units long. Modifications can occur anywhere along the chain, and these include O-­sulfation, N-­
deacetylation/N-­sulfation, and epimerization of the uronic acid. These are a particularly challenging class of 
compounds to characterize due to their heterogeneous structures, an outcome of their non-­template 
biosynthesis. Nevertheless, within the long glycan chains are short regions of defined modification that target 
specific proteins with remarkable specificity. These glycan-­protein interactions are the basis for the biological 
activity of the glycosaminoglycan. There is a critical need for tools to find these organized regions with the long 
glycan chain, and to determine their pattern of modification. A few specialized laboratories have developed 
mass spectrometry methods for the structural analysis of glycosaminoglycans, but these have not found their 
way into biological laboratories at large. The goal of this project is to produce a platform with a high degree of 
automation so that it can be deployed in the laboratories of biology researchers. The accessibility of these 
advanced mass spectrometry methods will result from innovations in hardware, software, and methods 
development.

## Key facts

- **NIH application ID:** 10005264
- **Project number:** 5U01CA231074-03
- **Recipient organization:** UNIVERSITY OF GEORGIA
- **Principal Investigator:** I JONATHAN AMSTER
- **Activity code:** U01 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2020
- **Award amount:** $294,738
- **Award type:** 5
- **Project period:** 2018-08-01 → 2022-07-31

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/10005264

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 10005264, An Automated Platform for the CE-MS Analysis of Glycosaminoglycans (5U01CA231074-03). Retrieved via AI Analytics 2026-05-24 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/10005264. Licensed CC0.

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*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*