# Elucidating the biological differences between distinct fibrillar and non-fibrillar alpha-synuclein inclusions in human stem-cell models

> **NIH NIH R01** · BRIGHAM AND WOMEN'S HOSPITAL · 2020 · $792,063

## Abstract

Summary 
Alzheimer’s  disease  (AD)  and  AD  related  dementias  (ADRD)  are  unpreventable,  incurable  and  remain  poorly 
understood. Their hallmark pathology consists of misfolded proteins in characteristic “inclusions” within subsets 
of neurons and glial cells of the brain. Misfolding of the membrane-­associated protein α-­synuclein (αS) is central 
to ADRD. Inclusions rich in αS in cortical and dopaminergic (DA) neurons are the hallmark lesions of dementia 
with Lewy bodies (DLB) and Parkinson disease with dementia (PDD). But αS inclusions are also found in >50% 
of  AD  cases,  correlating  with  cognitive  decline  and  frequently  colocalizing  with  tau  pathology.  αS  pathology  is 
strikingly  heterogeneous  and  poorly  understood.  Common  αS  pathology  comprises  vesicle-­rich  “pale  bodies” 
(PBs),  amyloid-­rich  Lewy  bodies  (LBs),  or  combinations  of  these.    PBs  have  indeed  been  discussed  as 
precursors  of  LBs,  but  what  gives  rise  to  PBs  and  how  they  may  convert  into  LBs  remains  enigmatic.  The 
ultrastructural  features  of  PBs  and  LBs  parallel  enormous  interest  in  the  field  in  both  amyloid  and  vesicle-­
trafficking pathologies in PD. In experimental settings, the seeding of neurons with pre-­formed fibrils leads to LB-­
like  amyloid aggregates.  These  aggregates  can  under  certain  conditions  spread and  self-­template  in adjacent 
cells. Different amyloid fiber conformers (“strains”) lead to different patterns of neurodegeneration, with differing 
levels  of  phosphorylated  αS  and  tau.  Human  genetic  studies  have  repeatedly  implicated  perturbed  vesicle 
trafficking and (membrane) lipid homeostasis as a fundamental and unifying feature in disparate forms of ADRD. 
We  hypothesize  that  altered  cellular,  and  especially  lipid,  microenvironments  can trigger  αS  amyloid  formation 
and the development of different strains and pathologies. An increasing body of evidence, including work from 
our  groups,  indeed  suggests  that  αS  toxicity  and  aggregation  can  be  modulated  by  altering  cellular  fatty  acid 
(FA) saturation or sphingolipid (SL) composition through manipulation of glucocerebrosidase (GBA) and stearoyl-­
coA  desaturase  (SCD),  respectively.  We  propose  to  dissect  the  influence  of  these  pathways  on  PB  and  LB 
formation  and  transition  in  the  most  disease-­relevant  patient-­derived  induced  pluripotent  stem  cell  (iPSC) 
models.  Importantly,  we  will  employ  patient  brain-­derived  “seed”  as  the  most  relevant  trigger  for  neuronal  αS 
aggregation. The use of both patient-­specific cell types and misfolded protein conformers will allow us to capture 
“in  the  dish”  both sides  of  the  toxic  equation  in  neurodegeneration.  We  recognize  the  importance,  but  also  the 
limitations,  of  postmortem  end-­stage  pathology  in  delineating  disease  mechanisms,  and  propose  to  establish 
cross-­corre...

## Key facts

- **NIH application ID:** 10052807
- **Project number:** 1R01NS109209-01A1
- **Recipient organization:** BRIGHAM AND WOMEN'S HOSPITAL
- **Principal Investigator:** Vikram Khurana
- **Activity code:** R01 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2020
- **Award amount:** $792,063
- **Award type:** 1
- **Project period:** 2020-07-01 → 2025-04-30

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/10052807

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 10052807, Elucidating the biological differences between distinct fibrillar and non-fibrillar alpha-synuclein inclusions in human stem-cell models (1R01NS109209-01A1). Retrieved via AI Analytics 2026-05-23 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/10052807. Licensed CC0.

---

*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*