# Virology Core: MIT Center for Human Tissue Models for Infectious Diseases (MIT.HTMID)

> **NIH NIH U19** · MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY · 2021 · $226,796

## Abstract

The MIT.HTMID Research Projects are dependent on a continuous supply of viruses for experimental work  
directed at developing Human Tissue Models for Infectious Diseases.  The purpose of the Virology Core to  
provide the authenticated and quantified viruses for the work. Authentication refers to defining: a) the source of  
the virus, b) the nucleotide sequence of the virus, c) the cell type used for passage and amplifiction, d) the  
passage number, e) the storage conditions. Quantified refers to defining the titers of infectious viruses by  
plaque assay or flow cytometry, or by quantifying viral RNA genomes by qRTPCR. In response to AI­16­022,  
we intend to test 2D and 3D human cerebral organoid cultures using several viruses; specifically, Dengue  
Virus, West Nile Virus, and Zika virus; moreover, we propose to use the 2D and 3D cultures to test the  
tropisms of a number of other neurotropic viruses using pseudotyped vesicular stomatitis viruses (VSV). The  
rigor of the  MIT.HTMID Center will be enhanced significantly by performing careful validation and  
quantification of the virus preparations. The flaviviruses are significant for this project because of their  
neurotropic properties; moreover, the use of pseudotyped VSVs will enable the MIT.HTMID Center to safely  
evaluate select agent viruses using the near­physiological cerebral organoids. Zika virus studies are significant  
because Zika has been linked to the development of fetal microcephaly. Dengue, Zika, and West Nile viruses  
are all members of the ​Flaviviridae​ family and are important pathogens that cause significant morbidity and  
mortality. Because the three flaviviruses have different infection phenotypes and pathogenesis outcomes, a  
comparison of virus replication in the 2D and 3D cultures will be extremely informative, and will provide  
ongoing positive and negative controls to enhance the rigor of the experimental work. The Virology Core will  
also be responsible for biosafety oversight so that all personnel in the MIT.HTMID Center follow guidelines  
required for using BSL2 and BSL3 viruses.

## Key facts

- **NIH application ID:** 10141196
- **Project number:** 5U19AI131135-05
- **Recipient organization:** MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY
- **Principal Investigator:** Lee Gehrke
- **Activity code:** U19 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2021
- **Award amount:** $226,796
- **Award type:** 5
- **Project period:** 2017-04-01 → 2024-03-31

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/10141196

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 10141196, Virology Core: MIT Center for Human Tissue Models for Infectious Diseases (MIT.HTMID) (5U19AI131135-05). Retrieved via AI Analytics 2026-05-22 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/10141196. Licensed CC0.

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*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*