# The HUSH complex in HIV-1 latency

> **NIH NIH R37** · UNIV OF MASSACHUSETTS MED SCH WORCESTER · 2021 · $783,287

## Abstract

Project Summary/Abstract 
Current anti-­HIV-­1 therapies prevent progression to AIDS but do not cure infection. HIV-­1 persists in long-­lived 
memory CD4+ T cells as a transcriptionally silent provirus, where it is undetectable by the immune system, and 
therefore  resistant  to  extirpation.  Recently,  we  reported  that  primate  immunodeficiency  virus  Vpx  and  Vpr 
proteins  activate  HIV-­1  provirus  transcription  by  degrading  the  three  proteins  of  the  human  silencing  hub 
(HUSH)  complex.  Disruption  of  the  HUSH  complex  in  bulk  CD4+  T  cells  increased  transcription  from  HIV-­1 
proviruses and kinetics of HIV-­1 spreading infections, indicating that the HUSH complex plays a dominant role 
in HIV-­1 provirus silencing. Nonetheless, examination of individual clones showed heterogeneity in response to 
HUSH disruption, and inconsistent correlation with known silencing factors such as SETDB1. Aim 1 will be to 
identify  requirements  for  HUSH  complex  silencing  of  the  HIV-­1  provirus.  Sets  of  CD4+  T  cell  clones 
bearing  HIV-­1  proviruses  that  exhibit  a  range  of  HUSH  responsiveness  will  be  subjected  to  loss-­of-­function 
screens to identify host silencing factors that distinguish clones with different HUSH phenotypes. Such factors 
will be characterized independently for effects on provirus transcription and provirus chromatin features. From 
these  experiments  we  expect  to  better  understand  how  HUSH  is  recruited  to,  and  maintains  transcriptional 
silencing  of,  HIV-­1  proviruses.  Aim  2  will  be  to  examine  the  role  of  the  HUSH  complex  in  CD4+  T  cell 
transcription and development. Disruption of the HUSH complex activates LINE-­1 expression in certain cell 
lines  raising  questions  about  possible  consequences  of  HUSH  complex  disruption.  Global  transcription  and 
chromatin profiling will be performed on primary human CD4+ T cells in which HUSH complex components are 
disrupted.  Increased  expression  of  particular  retrotransposons  is  expected,  but  also  immune-­related  genes  of 
relevance  to  HIV-­1,  and  markers  that  may  be  used  to  monitor  HUSH  complex  activity  in  cells.  Examination  of 
transcription factor motifs within lost ATAC-­Seq peaks will aid identification of DNA-­binding proteins that recruit 
the HUSH complex. The HUSH complex will also be disrupted in cord blood human CD34+ hematopoietic stem 
cells  used  to  reconstitute  an  immune  system  in  mice.  These  experiments  will  tell  us  whether  the  HUSH 
complex  is  essential  for  human  hematopoietic  development  generally  or  for  CD4+  T  cells  specifically.  Aim  3 
will  assess  the  contribution  of  the  HUSH  complex  to  HIV-­1  latency  in  vivo.  The  effect  of  HUSH  complex 
inactivation  on  HIV-­1  provirus  reactivation  will  be  examined  with  CD4+  T  cells  harvested  from  HIV-­1+ 
individuals  on  anti-­HIV-­1  suppressive  therapy  an...

## Key facts

- **NIH application ID:** 10176390
- **Project number:** 5R37AI147868-03
- **Recipient organization:** UNIV OF MASSACHUSETTS MED SCH WORCESTER
- **Principal Investigator:** JEREMY LUBAN
- **Activity code:** R37 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2021
- **Award amount:** $783,287
- **Award type:** 5
- **Project period:** 2019-07-01 → 2024-06-30

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/10176390

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 10176390, The HUSH complex in HIV-1 latency (5R37AI147868-03). Retrieved via AI Analytics 2026-05-23 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/10176390. Licensed CC0.

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*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*