Investigating the molecular and cellular mechanisms of virus-associated hepatocellular carcinoma

NIH RePORTER · NIH · K00 · $112,900 · view on reporter.nih.gov ↗

Abstract

PROJECT SUMMARY/ABSTRACT     Cancer  development  accompanies  with  the  dynamic  evolution  of  immunity,  a  well-­known  process  termed  as  immunoediting.  However,  the  underlying  mechanisms  of  the  transition  between  each  phase,  from  immune  surveillance to final escape, still remain a lot to discover. This proposal aims to study immunoediting during liver  cancer development and progression, with a focus on senescence and metastasis. Senescence is a cell cycle  arrest program that limits the expansion of damaged cells and can trigger anti-­tumor immunity that leads to their  elimination  in  vivo,  serving as a  potent  barrier  to  tumorigenesis.  However,  during  tumor  initiation,  the effective  clearance of senescent cells is compromised, warranting a deeper mechanistic understanding of this process.  My doctoral research aims to identify critical molecular and cellular players driving anti-­tumor immune responses  during senescence surveillance triggered by wildtype p53, which is known to modulates cancer immunity. The  long-­term objective of my thesis project is to define the mechanisms of how senescent cells are susceptible to  immune  surveillance  and  how  these  mechanisms  are  evaded  or  bypassed  during  cancer  development  and  progression. As described in Specific Aims 1.1-­1.3, my thesis work has demonstrated that the p53 restoration  triggers regression of liver cancers in an immunocompetent host. Using different immunodeficient mouse strains  and pharmacological approaches perturbing specific immune compartments, our preliminary data suggests that  adaptive  immunity  plays  a  key  role  in  senescence  surveillance.  RNA-­seq  and  mass  spectrometry  were  conducted  on  both  proliferating  and  senescent  tumor  cells  and  revealed  several  senescence-­enriched  cell  surface factors related to epithelial-­immune cell interactions. In Specific Aims 1.4 and 1.5, we aim to functionally  interrogate  the  role  of  these  senescence-­induced  factors  as  novel  senescence  surveillance  effectors,  with  a  focus on the regulatory network of antigen presentation pathway and, by exploiting multiplexed in vivo genetic  screens established in the Lowe laboratory. My postdoctoral research will continue to study immunoediting with  a slight change of the focus from the epithelial-­tumor angle to a more immunology-­rich perspective, applied to  the problem of metastatic immune escape. The proposal aims to investigate the molecular changes of NK cells,  shown to have control of early metastasis, after having physical interaction with metastatic cells. During different  stages of  metastatic  colonization,  tumor-­engaging  NK  cells are  labeled  via  “SynNotch”  technology and  will  be  subjected to single-­cell RNA-­seq to unveil the NK cell heterogeneity (Specific Aim 2.1) and ATAC-­seq to reveal  potential  epigenetic  mechanisms  of  immune  exhaustion  with  functional  perturbation  of  the  altered...

Key facts

NIH application ID
10813132
Project number
5K00CA245797-05
Recipient
ROCKEFELLER UNIVERSITY
Principal Investigator
HSUAN-AN CHEN
Activity code
K00
Funding institute
NIH
Fiscal year
2024
Award amount
$112,900
Award type
5
Project period
2019-09-01 → 2026-03-31