# Systems-level identification of host determinants of patient outcomes in Lassa fever and Ebola

> **NIH NIH U19** · SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE, THE · 2020 · $601,080

## Abstract

Project Summary / Abstract 
The  Eastern  Province  of  Sierra  Leone  has  the  world’s  highest  incidence  of  Lassa  fever.  Members  of  this 
research team have been working on Lassa fever at the Kenema Government Hospital (KGH) for over twelve 
years.  The  2013-16  West  African  Ebola  epidemic  began  less  than  a  four-hour drive from KGH and was the 
first  Ebola  outbreak  to  occur  in  an  area  close  to  an  existing  facility  for  viral  hemorrhagic  fever  basic  and 
clinical  research.  KGH  manages  up  to  600  suspected  Lassa  fever  patients  per  year,  and  Kenema  and 
surrounding districts experienced a large number of Ebola case. We will leverage existing samples from these 
established  cohorts  of  humans  infected  with  Lassa  fever  or  Ebola.  While  it  is  well  established  that 
asymptomatic or mildly symptomatic infections occur in both Lassa fever and Ebola, it is unknown which host 
factors  determine  the  progression  to  fulminant  hemorrhagic  fever.  Likewise,  a  substantial  portion  of  Lassa 
fever  and  Ebola  survivors  develop  a  plethora  of  serious  sequelae,  but  factors  that  predicate  these 
complications  remain  elusive.  Our  research  program  supports  both  Lassa  fever  and  Ebola survivor groups. 
We  propose  to  integrate  experimental  approaches  and  computational  modeling  to  test  and  validate 
hypotheses of significance to Lassa fever and Ebola. Our assembled team has a track record of collaboration, 
unique expertise with both Lassa virus and Ebola virus and the appropriate multidisciplinary representation in 
systems  and  computational  biology,  virology,  immunology,  genomics,  proteomics,  machine  learning, 
statistical methods and modeling required to execute the proposed program. Our overall goal in Project 1 is to 
generate an integrated dataset that can be used to build predictive models of patient outcomes in Lassa fever 
and  Ebola.  Studies  proposed  under Specific Aim 1 will define physiological attributes that distinguish Lassa 
fever  and  Ebola  survivors  and  non-survivors,  and  individuals  that  develop  serious sequelae. Specific Aim 2 
will elucidate the evolution and function of successful antibody networks in Ebola and Lassa fever survivors. T 
cell  dynamics  and  the  role  human  leukocyte  antigens  leading  to  successful  clearance  of  Ebola  virus  and 
Lassa virus will be defined in studies described in Specific Aim 3. In Specific Aim 4 we will develop and test 
predictive  models  for  the  role  of  host  factors  in  Lassa  fever  and  Ebola  outcome.  Project  1  on  host factors 
complements  the  studies  described  in  Project  2 on viral factors and integrates with and utilizes each of the 
Cores.

## Key facts

- **NIH application ID:** 9851808
- **Project number:** 5U19AI135995-03
- **Recipient organization:** SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE, THE
- **Principal Investigator:** Robert F Garry
- **Activity code:** U19 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2020
- **Award amount:** $601,080
- **Award type:** 5
- **Project period:** — → —

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/9851808

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 9851808, Systems-level identification of host determinants of patient outcomes in Lassa fever and Ebola (5U19AI135995-03). Retrieved via AI Analytics 2026-05-21 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/9851808. Licensed CC0.

---

*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*