Virology Core: MIT Center for Human Tissue Models for Infectious Diseases (MIT.HTMID)

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Abstract

The MIT.HTMID Research Projects are dependent on a continuous supply of viruses for experimental work  directed at developing Human Tissue Models for Infectious Diseases.  The purpose of the Virology Core to  provide the authenticated and quantified viruses for the work. Authentication refers to defining: a) the source of  the virus, b) the nucleotide sequence of the virus, c) the cell type used for passage and amplifiction, d) the  passage number, e) the storage conditions. Quantified refers to defining the titers of infectious viruses by  plaque assay or flow cytometry, or by quantifying viral RNA genomes by qRTPCR. In response to AI­16­022,  we intend to test 2D and 3D human cerebral organoid cultures using several viruses; specifically, Dengue  Virus, West Nile Virus, and Zika virus; moreover, we propose to use the 2D and 3D cultures to test the  tropisms of a number of other neurotropic viruses using pseudotyped vesicular stomatitis viruses (VSV). The  rigor of the  MIT.HTMID Center will be enhanced significantly by performing careful validation and  quantification of the virus preparations. The flaviviruses are significant for this project because of their  neurotropic properties; moreover, the use of pseudotyped VSVs will enable the MIT.HTMID Center to safely  evaluate select agent viruses using the near­physiological cerebral organoids. Zika virus studies are significant  because Zika has been linked to the development of fetal microcephaly. Dengue, Zika, and West Nile viruses  are all members of the ​Flaviviridae​ family and are important pathogens that cause significant morbidity and  mortality. Because the three flaviviruses have different infection phenotypes and pathogenesis outcomes, a  comparison of virus replication in the 2D and 3D cultures will be extremely informative, and will provide  ongoing positive and negative controls to enhance the rigor of the experimental work. The Virology Core will  also be responsible for biosafety oversight so that all personnel in the MIT.HTMID Center follow guidelines  required for using BSL2 and BSL3 viruses.

Key facts

NIH application ID
9903205
Project number
5U19AI131135-04
Recipient
MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY
Principal Investigator
Lee Gehrke
Activity code
U19
Funding institute
NIH
Fiscal year
2020
Award amount
$175,428
Award type
5
Project period
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