# Mechanisms of Archaeal Transcription Termination

> **NIH NIH R01** · COLORADO STATE UNIVERSITY · 2020 · $282,440

## Abstract

Project Summary/Abstract 
 
 
Timely and accurate regulation of gene expression is required for proper growth, development, 
and response to environmental stimuli.  A complete understanding of the mechanisms 
employed to regulate gene expression is necessary to combat the aberrant regulation that 
underlies many human developmental conditions and ailments, including cancer.  The long-­term 
goals of this proposal are to determine the mechanics of RNA synthesis by DNA-­dependent 
multi-­subunit RNA polymerases (RNAPs), the regulation imposed on RNAP by conserved 
protein factors, select template sequences and chromatin-­barriers, and to specifically 
characterize the available mechanisms to halt RNA synthesis and terminate transcription.  The 
proposed experiments take advantage of an established in vivo and in vitro archaeal 
transcription system from the marine hyperthermophilic organism Thermococcus kodakarensis.  
Archaea offer the advantages of far less complexity but homology in many features of human 
molecular biology, specifically conservation of RNAP structure and function and histone-­based 
chromatin.  We will characterize factor-­dependent and intrinsic transcription termination, 
polarity, the consequences of DNA damage on transcription elongation and termination, and the 
role of global transcription regulation in archaeal physiology.  The results obtained will 
determine the structures and sequences that support transcription elongation complex stability, 
describe the mechanics of termination and allow comparisons of termination mechanisms in 
each domain of life, and provide insight to control and ultimately manipulate gene expression to 
counter a variety of diseases and ailments affecting human health.

## Key facts

- **NIH application ID:** 9918908
- **Project number:** 5R01GM100329-09
- **Recipient organization:** COLORADO STATE UNIVERSITY
- **Principal Investigator:** Thomas James Santangelo
- **Activity code:** R01 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2020
- **Award amount:** $282,440
- **Award type:** 5
- **Project period:** 2012-02-01 → 2022-04-30

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/9918908

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 9918908, Mechanisms of Archaeal Transcription Termination (5R01GM100329-09). Retrieved via AI Analytics 2026-05-24 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/9918908. Licensed CC0.

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*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*