# Outreach Core

> **NIH NIH U54** · OREGON HEALTH & SCIENCE UNIVERSITY · 2020 · $152,479

## Abstract

ABSTRACT -­ Outreach Core  
The  Outreach  Core  of  the  M2CH-­CSBC  (Measuring,  Modeling  and  Controlling  Heterogeneity-­Cancer  Systems  
Biology Consortium) Center will deliver educational materials, experimental and computational tools and data to  
the CSB Consortium, the CSBC/PS-­ON Coordinating Center and the broader scientific community. The Outreach  
Core  with  logistical,  support  from  the  Administrative  Core,  will:  (1)  deliver  interdisciplinary  education  and  cross-­ 
training  on  multiscale  measurement  instrumentation,  and  the  generation,  use,  and  analysis  of  4D  images  
impacting  cancer  and  therapeutic  response;;  (2)  provide  access  to  the  bioimaging  and  genomic  data  using  a  
custom  portal  for  access,  visualization,  and  interactive  analysis  based  on  OMERO  (Open  Microscopy  
Environment  image  database)  and  Sage  Synapse;;  and  (3)  conduct  DREAM  crowd-­sourcing  activities  to  seek  
analytical solutions to question in spatial systems biomedicine.  Aim 1 will deliver introductory and advanced topic  
workshops  on  unique  imaging  platforms  accessible  to  the  CSBC  and  general  public.    Hands-­on  training  
workshops utilizing multiscale imaging instrumentation, optimized techniques and workflows, and computational  
analytics also will be provided as part of a biannual multiscale imaging symposium. This symposium designed to  
foster collaboration among biomedical scientists, bioengineers, mathematicians, and computational biologists, at  
all stages of their careers, will support the interdisciplinary and trans-­consortium interactions that are fundamental  
to  achieving  the  CSBC  research  goals.    Cross-­network  personnel  exchanges  for  in-­depth  training  are  offered.  
Aim  2  will  build  on  an  existing  collaboration  with  Sage  Bionetworks  and  leverage  work  conducted  under  the  
auspices  of  the  NIH  Library  of  Integrated  Network-­Based  Cellular  Signatures  (LINCS)  Common  Fund  and  Big  
Data  to  Knowledge  (B2DK)  Programs  to  make  computational  infrastructure  for  accessing,  visualizing,  and  
quantitatively analyzing bioimaging data available to the CSBC and wider research community. This will include:  
(a) access to M2CH-­CSBC image and single cell sequencing data from our customized workflow platforms, (b)  
development  of  a  Sage  Synapse  based  M2CH-­CSBC  public  data  portal  that  will  leverage  our  metadata  
management,  provenance  tracking,  data  versioning,  governance  and  access  control  analysis  and  visualization,  
and  (c)  powerful  image  analytics  and  integration  of  imaging  and  single  cell  sequencing  data  through  analytical  
and visualization tools optimized by OHSU Center for Spatial Systems Biomedicine (OCSSB) collaborators.  Aim  
3  will  work  with  Sage  Bionetworks  to  develop  crowd-­sourcing  solutions  to  ‘omic/image  data  visualization,  
identification  of  netw...

## Key facts

- **NIH application ID:** 9964677
- **Project number:** 5U54CA209988-04
- **Recipient organization:** OREGON HEALTH & SCIENCE UNIVERSITY
- **Principal Investigator:** PAUL T. SPELLMAN
- **Activity code:** U54 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2020
- **Award amount:** $152,479
- **Award type:** 5
- **Project period:** 2020-05-01 → 2022-04-30

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/9964677

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 9964677, Outreach Core (5U54CA209988-04). Retrieved via AI Analytics 2026-05-23 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/9964677. Licensed CC0.

---

*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*