# Advancing Cancer Research through Comprehensive Proteomics and Metabolomics Analyses

> **NIH NIH R50** · WISTAR INSTITUTE · 2020 · $188,535

## Abstract

PROJECT SUMMARY 
 
The Proteomics and Metabolomics Facility, supported by the Cancer Center Support Grant (CCSG) awarded 
to The Wistar Institute, provides a comprehensive set of proteomics and targeted quantitative metabolite 
assays to the Wistar Cancer Center membership as a primary goal.  Resources of this Facility are also 
available to investigators in other Cancer Centers and other academic investigators as a secondary goal.  Dr. 
Tang’s role as the Facility Managing Director is to support cancer research and other biomedical research by 
providing expert consultation and state-­of-­the-­art technologies that operate at maximum performance at 
affordable costs to users.  The Managing Director will assist in experimental design, manage Facility staff, 
perform MS data analyses as needed, and assist in the biological interpretation of results.  The Managing 
Director will also devote substantial effort to optimizing and implementing new methods, update analytical and 
data analyses methods, and update instrumentation to ensure each project is performed using state-­of-­the-­art 
methodologies.  This is critical because instrumentation, software, and analytical strategies continue to evolve 
rapidly, and most current and anticipated future projects involve very challenging proteomics and 
metabolomics problems.  Proteomics projects will include: 1) LC-­MS/MS analysis of isolated protein complexes 
with and without chemical crosslinking, 2) in-­depth, global, quantitative comparisons of exosomes, secretomes, 
and cell lysates, and 3) targeted and global quantitative comparisons of posttranslational modifications.  
Quantitative data will be obtained either using label-­free quantitation of integrated MS ion currents, or 
quantitation using stable isotopes such as SILAC or isobaric tag (TMT or iTRAQ) labeling.  The proteome 
analyses will use optimized methods and state-­of-­the-­art instruments, such as the Thermo Scientific Q 
Exactive HF mass spectrometer, that can detect and robustly quantify most of the proteins present in complex 
samples, including whole cell lysates.  Metabolomics projects will include quantifying the steady state levels of 
key metabolites using targeted multiplex MRM-­MS on the Sciex QTRAP 5500 hybrid triple quadrupole linear 
ion trap mass spectrometer.  Plans for future development include: 1) expanding depth of proteome analyses 
to efficiently analyze greater than 90% of gene products expressed by cells and tissues, 2) implementing 
routine use of chemical cross-­linking to identify protein-­protein interactions and obtain structural information, 3) 
implementation of metabolite flux analyses using 13C stable isotope tracer, and 4) implementation of lipidomics 
analyses.  All of these new methods will use the Thermo Scientific Q Exactive mass spectrometers or future 
next generation instruments.  These proteomics and metabolomics analyses will contribute to critical data 
required to identify protein and metabolit...

## Key facts

- **NIH application ID:** 9996531
- **Project number:** 5R50CA221838-04
- **Recipient organization:** WISTAR INSTITUTE
- **Principal Investigator:** Hsin-Yao Tang
- **Activity code:** R50 (R01, R21, SBIR, etc.)
- **Funding institute:** NIH
- **Fiscal year:** 2020
- **Award amount:** $188,535
- **Award type:** 5
- **Project period:** 2017-09-20 → 2022-08-31

## Primary source

NIH RePORTER: https://reporter.nih.gov/project-details/9996531

## Citation

> US National Institutes of Health, RePORTER application 9996531, Advancing Cancer Research through Comprehensive Proteomics and Metabolomics Analyses (5R50CA221838-04). Retrieved via AI Analytics 2026-05-23 from https://api.ai-analytics.org/grant/nih/9996531. Licensed CC0.

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*[NIH grants dataset](/datasets/nih-grants) · CC0 1.0*